北京基因組所高性能(néng)計算擴容項目
來源: | 作者:吳昊 | 發(fā)布時(shí)間: 2022-05-30 | 1156 次浏覽 | 分享到(dào):
本項目旨在滿足北京基因組所前沿科研需求,用于生命科學(xué)領域前門跳沿新興學(xué)科的計算模拟需求。滿足實驗與研究些金中心的組學(xué)數據(全基因組、雪文外顯子、RNA、蛋白質組數據)的存儲、處理和運算的需求(約1萬人/都劇年)。

項目背景:中國(guó)科學(xué)院學很北京基因組研究所生命與健康大數據中心(BIG Data Center, BIGD)于2016年2月29日正式近些成(chéng)立。生命與健康大數據中心,穩居中科院生命領域計算排名之但但首,已達到(dào)1.6Gbps網兒人絡帶寬,總計算能(néng)力100萬微日億次/秒。為中科院内外16家生命科研單位,共74個課題你她組的提供基本數據儲存與共享服務,平均每天活躍用戶超過體什(guò)500位,每天完成(放快chéng)計算任務多達3000餘個。

 

需求分析:本項目旨在滿足北京基因組所前沿科研需求,用于生命科學(xu亮老é)領域前沿新興學(xué)科的計算模拟需求。滿足實驗與研究中心的如物組學(xué)數據(全基因組、外顯子、RNA、蛋白質組數據)的存儲、處理和運算的需求(約1萬人/年)。

構建高性能(néng)運算集群所需的服務器、存儲、坐鐘網絡連接、信息安全等硬件設備。

提供高性能(néng)運算集群所需的集群雪雜管理、作業調度等軟件,以及軟件的安裝調試。

 

計算系統

包括30台曙光TC4600E刀片(Intel Xeon E地國5-2650v4 2.2G 35M 12C*2;16G DDR4 跳綠2133 ECC REG 内存*8)以要多及2台曙光I840-G20四路服務器答風,峰值性能(néng)為29286.4GFlops

管理登錄系統:

包括4台曙光I620-G20機架服務器(雙路I算行ntel Xeon E5-2620v3 2.4G,64GB mem藍電),部署曙光Gridview集群管理系統,PB讀如S作業調度系統。

存儲系統:

包括1套ParaStor300雲存儲系統索引控制線能器2,數據控制器11台,總裸容量1584TB。1套件做曙光DS600-G20磁盤陣列,總裸容量384TB。

網絡系統

包括2台36端口Infiniband FDR交換機(56Gb/s)。